我国科学家完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制
鲤科鱼类是我国最主要的水产养殖种类 ，年产量占我国淡水养殖总产量的70%以上 ，其中鲤鱼不但是我国也是天下性的主要养殖鱼类 。5月6日 ，中国“鲤鱼基因组妄想”学术报告会暨新闻宣布会在京举行 。由中国水产科学研究院水爆发物应用基因组研究中心、黑龙江水产研究所和中科院北京基因组研究所配合实验的“鲤鱼基因组妄想”乐成完成了鲤鱼全基因组测序 ，并绘制了鲤鱼基因组框架图谱、基因组物理图谱和高密度连锁图谱 ，为鲤鱼基因组辅助育种研究、优良品种快速培育提供了主要基础 。
鲤鱼基因组有100条染色体 ，是现在完玉成基因组测序研究物种中染色体数目最多的动物 。此次宣布的鲤鱼基因组框架图 ，是以中国养殖最广的鲤鱼品种的雌核发育纯系单个个体为测序工具 ，测定了凌驾100倍笼罩率的高质量数据 。中科院北京基因组研究所经由全基因组鸟枪法数据拼接和组装等多种手艺途径 ，已经完成鲤鱼全基因组序列图谱绘制事情 。鲤鱼基因组巨细约为1.7Gb,拼接组装所获得的Scaffold的N50长度为404 kb 。别的 ，还爆发了7万多条鲤鱼BAC克隆最后序列、166万条的表达序列标签和由8万多个BAC克隆组成的基因组物理图谱 �？蚣芡蓟至至�96.5%的BAC文库最后序列、96.2%的表达序列标签和95%的物理图谱 。
鲤鱼在我国有几千年的养殖历史 ，经由长时间的自然分解、人工选育 ，形成了形态多样、体色富厚、有鳞无鳞、对特殊情形具有较强顺应性的多个地方种群和品种 ，使我国成为天下上鲤鱼种质资源和基因组资源最富厚的国家 。据天下粮农组织统计 ，鲤鱼养殖工业全球年产量凌驾300万吨 。鲤鱼照旧现在我国培育出品种最多的水产养殖种 ，在以使用基因组资源改良动植物经济性状为特征的现代农业育种手艺生长历程中 ，鲤鱼是我国最有条件使用基因组资源举行品种改良的水产养殖物种 。从物种进化角度看 ，鲤鱼是已开展全基因组研究物种中全基因组复制事务最多的物种 ，而全基因组复制作为生物基因组进化的主要历史事务在现实物种的基因组中都留下主要证据 。因此 ，鲤鱼全基因组测序效果不但对鲤鱼基因组辅助育种研究 ，快速培育抗病、抗逆、优质、高产的优良品种提供主要基础 ，并且对鲤科鱼类物种进化和种类分解的剖析也具有主要价值 。
鉴于鲤鱼基因组资源对鲤的育种研究和基础研究的重大意义 ，2009年底 ，中国水产科学研究院水爆发物应用基因组研究中心、黑龙江水产研究所团结永利集团启动了“鲤鱼基因组妄想” ，经由1年多的受苦攻关 ，于今年4月尾乐成完成了包括基因组框架图、物理图谱和高密度连锁图谱在内的一系列效果 。该效果的完成,将使鲤鱼全基因组序列的装配效果与物理图谱和高密度连锁图谱实现整合 ，起源形成鲤鱼基因组细腻图谱 ，使经济性状的遗传图谱定位跨越到基因组图谱和功效基因的准确定位 ，标记着鲤鱼分子育种等相关研究正式进入基因组时代 ，这将一定推动鲤鱼育种手艺的周全前进 。使人们有可能完整掌握经济性状形成的所有基因 ，如影响肉品质、影响肌间刺形成的基因 ，从而获得肉质好、肌间刺少的受接待的新品种 。本研究效果将有助于推进在基因组水平开展鲤鱼经济性状遗传机制和功效基因的细腻研究 ，推动基于基因组信息的水产育种手艺的革命 。
科技部农村司综合妄想随处长许增泰、农业部科教司政策系统随处长张国良、中科院农业项目办公室常务副主任段子渊、中科院北京基因组研究所副所长于军、科技随处长严江伟 ，以及中山大学林浩然院士、美国奥本大学刘占江教授、中科院海洋研究所原所长相建海研究员、中国海洋大学包振民研究员、中国农业科学院作物科学研究所毛龙研究员、中国水产科学研究院黄海水产研究所陈松林研究员等专家及新华社、中央电视台、科技日报、科学时报等新闻媒体记者40余人加入了报告会和新闻宣布会 。
鲤鱼基因组高密度连锁图谱
