北京基因组所相助完成鲤鱼基因组序列图谱绘制
克日，永利集团于军研究组团结中国水产科学研究院、哈佛大学、奥本大学等单位完成了鲤鱼全基因组序列图谱绘制，这也是国际上首个完玉成面剖析的异源四倍体硬骨鱼类基因组图谱。该研究效果于2014年9月21日在国际生物学权威期刊Nature Genetics在线揭晓。
鲤鱼是全球漫衍和养殖规模最普遍的经济鱼类之一，同时是我国最具代表性的淡水养殖鱼类和最有条件使用基因组资源举行品种改良的水产养殖物种之一。鲤鱼基因组由100条染色体组成，是迄今完玉成基因组测序的脊椎动物中染色体数目最多的物种，其基因组履历了四轮复制，因此，也是迄今为止完成剖析的最为重大的四倍化脊椎动物基因组之一。
在研究所大规模测序平台及高性能盘算平台的有力支持下，该研究团队完成了雌核发育鲤鱼的基因组深度测序、细腻图谱绘制和基因组注释。在遗传图谱信息的基础上，科研职员使用基因组组装效果，将鲤鱼基因组定位到染色体上，获得了较完整的鲤鱼细腻图谱。其基因组由16.9亿碱基组成，含有52610个功效基因，约为大都硬骨鱼类基因数目的两倍。研究团队从基因组标准证实了鲤鱼基因组的异源四倍体特征及其奇异的全基因组复制事务，分子钟证据批注鲤鱼基因组四倍化约莫爆发在820万年前，是迄今在脊椎动物中发明的最近的全基因组倍增事务。
研究团队还开展了全球10个代表性品系（种群）33尾鲤鱼的基因组重测序研究，首次绘制了全球鲤鱼的单碱基区分率基因组遗传变异图谱。别的，通过全基因组多态性扫描和较量转录组剖析等手段，识别和定位了鲤鱼鳞被缺失、体色决议等性状相关的遗传位点、功效基因和调控通路。
鲤鱼全基因组序列图谱的完成，标记着鲤科鱼类主要经济性状的遗传剖析和遗传选育研究周全进入基因组时代。关于剖析鲤科鱼类生长、品质、抗病、抗逆等主要经济性状的分子机制具有主要意义，同时也为研究脊椎动物基因组进化和基因衍化机制提供了名贵的数据和模子，为开展全基因组选择育种，培育品质优良的鲤鱼新品种涤讪了坚实基础，具有主要的理论意义和应用价值。
文章链接
鲤鱼的较量基因组学研究
鲤鱼种群的全基因组遗传多态性及分解特点
