基因组所开发完成DNA甲基化重编程数据库
DNA甲基化是一个主要的表观遗传标记，在胚胎早期发育历程中起到至关主要的作用，差别物种所接纳的机制亦各不相同。因而，整合多个物种的海量甲基化数据并提供在线的数据浏览、获取及其功效剖析，可资助更多研究职员深入探析差别物种在早期发育时期的DNA甲基化差别，并展现其DNA甲基化重编程历程与机制。
中科院北京基因组所基因组科学与信息重点实验室章张研究组、刘江研究组以及所级中心信息室组成的开发团队，在研究所高性能盘算平台和大数据存储平台的有力支持下，配合开发完成“基于高通量测序的单碱基精度DNA甲基化重编程数据库MethBank”，该效果于2014年10月在国际生物信息学领域期刊Nucleic Acids Research在线揭晓。
MethBank是面向多种模式生物配子和早期胚胎多个差别发育时期的DNA甲基化组重编程数据库，整合的数据包括甲基化水平、差别甲基化区域、CpG岛甲基化水一律，所有是全基因组单碱基精度的DNA甲基化数据，且集成了其它包括基因表达信息、SNP信息等在内的相关组学数据信息。别的，MethBank提供一个支持多组学数据的交互式甲基化浏览器，能够高区分度的实现DNA甲基化图谱以及其它相关数据的可视化。
MethBank现今整合集成了斑马鱼和小鼠各自9个差别发育时期的全基因组单碱基精度DNA甲基化数据，每个时期包括全基因组约90%CG位点的甲基化信息，且对应的数据库表存有上万万条纪录，数据库存储巨细划分为15G和9G。MethBank的开发建设实现了海量甲基化大数据的整合与可视化，为后续其它多个物种的大数据整合提供了流程要领和数据平台。
该项研究获得了永利集团、科技部和国家自然科学基金委的资助。
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