北京基因组所（国家生物信息中心）开发分子序列组分动态图谱数据库CompoDynamics
生物体的核酸与卵白质分子的序列组分及相关特征（如GC/AG含量、密码子使用偏好、卵白质物理化学性子等）关于研究基因功效和物种演化具有主要意义，是明确差别物种、差别基因家族以及差别功效基因之间差别的数据基础 。
克日，由永利集团（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心开发的分子序列组分动态图谱数据库CompoDynamics正式上线，旨在对序列组分的动态转变提供综合、周全的展示，以多物种的系统性较量剖析为基础，为深入的分子演化研究提供主要的参考和启示 。该研究效果以 “CompoDynamics: a comprehensive database for characterizing sequence composition dynamics”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research 在线揭晓 。
CompoDynamics针对RefSeq数据库的基因组注释信息，划分盘算剖析了基因和基因组层面的3类序列组分特征（碱基组成、密码子使用偏好、氨基酸组成）和3类相关序列特征（编码潜能、卵白物理化学性子、相疏散特征） 。现在，CompoDynamics共包括24,995个物种、34,562个基因组、1,692,647个基因，以及118,689,747条开放读码框序列 。每条序列或每个基因组均有专门页面临各项特征举行详尽展示，并在主页以组分／特征分类展示 。用户可通过物种分类、物种名、装配号、基因序列号、卵白名称等举行检索 。别的，CompoDynamics还提供了SpeciesComparator、FamilyComparator、GOComparator和CompoAnalyzer 4个在线较量剖析工具，划分用于物种间、基因家族间、基因功效层面的各项组分／特征较量剖析，支持对用户提供序列的盘算剖析，增进多组分特征和多维度的分子演化研究 。
北京基因组所（国家生物信息中心）助理研究员降帅、硕士研究生杜强和冯昶瑞为本文配合第一作者，马利娜副研究员与章张研究员为配合通讯作者 。该研究获得了科技部、中科院战略性先导科技专项、国家自然科学基金委、中科院青促会项目资助 。
论文链接
CompoDynamics数据库内容与结构
