北京基因组所（国家生物信息中心）宣布生物标记物知识库BioKA
生物标记物（Biomarker）是能够被客观丈量并评价的指标，可以用来指示心理、病理历程以及对治疗步伐的药理反应。生物标记物不但是诊断剖析生长、确定新药研发靶标的基础，也是培育新品种的基础，在个性化医疗、药物研发、临床照顾护士和分子育种等多个领域施展主要作用。
克日，永利集团（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心宣布生物标记物知识库（Biomarker Knowledgebase for Animals，简称BioKA），并以“BioKA: A curated and integrated biomarker knowledgebase for Animals”为题在国际学术期刊Nucleic Acids Research 在线揭晓，不但富厚了人类标记物信息，也填补了已有的生物标记物数据资源在动物疾病和动物分子育种方面的空缺。
BioKA从4,747篇文献中人工审编与整合了人和30个动物物种（包括模式动物及家养动物等），总共951个疾病/性状相关的16,296个生物标记物（包括11,925个基因/卵白，1,784个miRNA，1,043个突变，773个代谢物，357个circRNA和127个lncRNA），并提供了经由标准化后的308个品种以及响应的生物标记物信息。用户可以通过名称、疾病、物种等要害词或基因/卵白序列检索特定生物标记物并获得富厚的注释信息（包括卵白相互作用、miRNA靶点、变异信息、基因表达信息等）。特殊地，BioKA针对人类生物标记物研究，审编并收录了用于验证的动物模子和实验信息，为生物标记物的可靠性提供可溯性支持。BioKA还提供16个物种的8,784个生物标记物的同源注释信息，为通过跨物种较量掘客新的生物标记物和潜在的动物模子提供便当。别的，BioKA提供了涵盖10个物种、7,320个实体的知识图谱可视化，整合了卵白-卵白相互作用、circRNA-miRNA-mRNA以及lncRNA-miRNA关联等多种调控关系，为新的生物标记物掘客以及相关机制研究的开展提供支持。
BioKA提供的周全富厚的知识不但能起劲增进人类疾病研究，同时也能增进动物疾病的研究和家畜的育种支持。
永利集团（国家生物信息中心）硕士研究生王钇博、唐碧霞高级工程师、硕士研究生林毅豪及吴思承为本文配合第一作者，唐碧霞高级工程师和赵文明正高级工程师为配合通讯作者。本事情获得国家自然科学基金资助。
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