北京基因组所（国家生物信息中心）研究展现m6A调控地中海涡虫再生气制
克日 ，永利集团(国家生物信息中心) 杨莹、杨运桂、韩鼎力大举和张维绮以配合通讯作者在Cell Proliferation 杂志上揭晓了题为“m6A promotes planarian regeneration”的研究论文 。这项研究使用MeRIP-seq及scRNA-seq手艺 ，绘制了地中海涡虫再生历程中的RNA m6A修饰图谱和单细胞转录组图谱 ，展现m6A 修饰调控涡虫再生气制 。
在本研究中 ，相助团队发明m6A甲基转移酶复合物在涡虫再生历程中上调 ，且m6A修饰水平在涡虫再生历程中泛起动态转变 。别的 ，还发明敲低m6A甲基转移酶调理亚基wtap ，会导致m6A水平急剧下降 ，并抑制涡虫再生 。通过多组学数据剖析发明 ，m6A修饰基因与信号传导和细胞通讯等相关通路相关 ，并发明wtap敲低后造成涡虫细胞周期异常 ，M期细胞的百分比显著增添 ，且细胞周期卵白依赖性激酶7 (cdk7) 和细胞周期卵白依赖性激酶 9 (cdk9)的表达上升 。进一步发明双重敲低wtap与cdk7或cdk9 ，可部分拯救wtap单敲导致的再生受阻表型 ，批注wtap可能通过调理细胞周期相关基因的表达调控涡虫再生 。通太过析敲低前后的单细胞转录组数据 ，发明神经元细胞比例在wtap敲低后下降 ，通过亚型剖析发明了一类wtap敲低后爆发的奇异的神经祖细胞样细胞亚型（NP样细胞） ，并判断到该亚型的主要标记基因grn和ubiqp 。进一步视察双敲wtap和grn的涡虫的表型 ，发明双重敲低在一定水平上显著拯救了涡虫再生受阻表型；双重敲低grn、cdk7或cdk9与wtap ，会导致NP样细胞亚型比例镌汰 ，批注wtap介导的m6A通过调控grn表达 ，进而影响涡虫再生 。
综上所述 ，该研究剖析了地中海涡虫中wtap敲低前后的组学特征转变 ，并通过构建涡虫基因敲低系统 ，发明m6A甲基转移酶调理亚基WTAP通过调理细胞周期及细胞间通讯基因的表达从而调控涡虫再生的机制 ，并发明wtap敲低诱导爆发了一类奇异的神经祖细胞类细胞亚型 。
该研究获得了来自永利集团、国家自然科学基金委和科技部等项目的资助 。
论文链接
m6A通过WTAP介导调控涡虫再生
