北京基因组所（国家生物信息中心）一站式新冠病毒综合信息平台周全升级
新冠肺炎（COVID-19）是近一个世纪以来撒播规模最广、影响最大的盛行病，新冠病毒（SARS-CoV-2）的基因组序列数目远超其他已知病毒序列的总和。海量的新冠病毒基因组序列对数据的快速整合剖析与挖掘带来了亘古未有的挑战。新冠肺炎疫情仍在全球伸张，新冠病毒的基因组也在一直爆发变异和演化，生长并建设大规模新冠病毒基因组数据的自动化整合、实时监测和高危害株系预警的要领平台具有主要应用价值和科学意义。
永利集团（国家生物信息中心）于2020年1月22日，率先果真宣布全球第一个新冠病毒综合性信息库RCoV19。该信息库一连动态整合全球新冠病毒基因组序列及元信息，支持全球新冠病毒基因组数据的汇交存储与共享，并提供突变注释信息和演化支系等信息，已生长为国际上规模最大、资源最富厚的新冠病毒研究公共平台。为更好效劳新冠病毒科学研究与基于基因组大数据的监测预警系统建设，研究团队于近期对RCoV19举行了周全的升级和完善。
RCoV19开发了全自动化的数据智能审编模子和数据共享页面，用于开展全球新冠病毒基因组数据自动化网络、去冗余、交织引用、质量评估等事情。该模子可一连提供实时周全的新冠病毒基因组元信息、全球漫衍与统计等信息，并提供高效的个性化高级检索效劳。
基于数据库整合的海量数据，RCoV19建设了基因组快速变异剖析流程、单倍型网络演化构建算法以及基于机械学习的高危害株系预警模子，开发了新冠病毒撒播演化实时监测平台、高危害变异株预警可视化系统和交互式突变谱快速比对功效�？�，实现了新冠病毒基因组序列、变异和演化支系的可视化动态监测，高危害变异株的及早预警，以及主要序列或谱系的变异特征纪律剖析。上述要领平台为基因组大数据驱动的公共卫生清静响应提供了主要的手艺和数据支持。
别的，RCoV19人工审编了新冠病毒基因组突变的效应知识，涵盖熏染性/熏染性、抗体抗性、药物抗性和T细胞表位等，可资助科研职员及防控政策决议职员更好地明确新冠病毒的变异特征，为科学研究及防控决议提供主要的参考依据。
总之，一站式新冠病毒基因组信息库RCoV19，是集新冠病毒基因组数据自动整合、变异监测、危害预警和突变效应知识于一体的全链条的综合性平台，将增进全球规模内的新冠病毒科学研究，并为全球公共卫生清静系统的建设提供有力支持。
上述研究以“RCoV19: A One-stop Hub for SARS-CoV-2 Genome Data Integration, Variant Monitoring, and Risk Pre-warning”为题在国际学术期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在线揭晓。永利集团（国家生物信息中心）李翠萍工程师、马利娜副研究员、邹东高级工程师和硕士生张荣钦为该文配合第一作者，鲍一明研究员和宋述慧研究员为该文配合通讯作者。本研究获得了永利集团战略重点研究妄想、2022年度“一带一起”国际科学组织同盟团结研究相助专项、国家自然科学基金和永利集团青年立异增进会等项目的支持。
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