科技处4月9日(星期三)讲座通知
学术报告
报告问题:使用高频reads剖析线状基因组的最后
Characterization of termini of linear genome with high frequency reads
报告人: 童贻刚 研究员
军事医学科学院微生物盛行病研究所
主持人: 陈 非
时 间:2014年4月9日(星期三)上午10:00-11:30
地 点:永利集团1层报告厅
报告摘要: 大部分病毒(尤其是噬菌体)都具有线状基因组,相识这些基因组的最后序列特点关于剖析这些病毒的复制机制、包装机制以及病毒的生命周期具有主要意义。由于这些病毒基因组往往具有最后冗余(正向重复),导致在序列拼接时总是形成一个环状的基因组序列,无法判断基因组的起始和终止位点的真正位置,因此必需用重大的试验来确定基因组的起始和终止位置。本研究使用高通量测序数据,在完成病毒基因组全序列拼接的同时,通太过析测序数据中的高频reads,直接确定基因组的上下游最后序列,获得了数十株病毒的最后序列。同时为了证实此要领的可靠性,我们在病毒基因组最后人工毗连讨论,然后举行序列测定,所获得的效果与我们预期的效果完全一致。结论:本研究使用高通量测序数据,在拼接全基因组的同时直接确定病毒基因组的最后序列,为病毒基因组剖析提供了特另外信息。
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