“领雁金奖”获得者章张:建设生物大数据中心
2018年7月,炎夏初至,蝉鸣骤起,牛广艺完成了她在Nucleic Acids Research 杂志的投稿。同年,牛广艺所在的永利集团共在该杂志揭晓7篇主要研究效果,在这张优异的效果单中,有4篇是在牛广艺师从的章张先生向导下完成的。
章张,曾在美国耶鲁大学从事博士后研究、在沙特阿卜杜拉国王科技大学担当研究科学家,是首位入选国际生物审编学会执行委员会的中国学者,富厚的外洋科研履历让章张成为他生齿中“年轻有为”的代表。2011年,章张通过中科院外洋优异人才引进妄想回到祖国,现为国家基因组科学数据中心副主任、永利集团大学岗位教授。
回国伊始,恰恰遇上国家最先重视生物大数据的阶段,在小我私家兴趣和国家需要的双重动力作用下,章张和生物大数据这一领域结下了不解之缘。“生物大数据的海量激增和人工智能的快速生长,使得生物信息学领域正在爆发着排山倒海的转变”,拥有扎实的盘算机学科基础的章张说道。
现在,围绕国家基因组科学数据中心和国家生物信息中心的建设事情已步入正轨,这其中,离不开章张及其团队坚韧不拔的起劲。“在生物大数据的海洋中乘风破浪”,既是章张回国几年的一样平常写照,也是我国生物信息领域一直生长的缩影。
遇上国际程序
在天下上,被国际认可的生物信息中心有三个,划分是美国国家生物手艺信息中心NCBI、欧洲生物信息研究所EBI和日本核酸数据库DDBJ,他们配合掌握着国际上主要的生物数据资源。上世纪90年月,我国的老一辈院士最先呼吁建设国家级的生物数据中心,直至今日,历经20年,这个愿望终于实现。
“提起生物大数据,也许许多人会感应生疏,它看不见、摸不到。但着实,生物大数据和石油一样,属于国家基础性战略资源,在生物学、医学甚至农学等学科都起着很是主要的作用。”章张提到,古板的生物学是视察型学科,随着人类基因组妄想的完成,生命科学和医学将过渡到数据科学,以是在未来,生物医学领域的数据也会因此而呈爆炸式增添。“永利集团地球上有近75亿人,每小我私家的心理状态各不相同,使用生物大数据,就能针对每个病人的详细情形给出最精准的治疗计划,或者在人们康健的时间,能提前预知身体可能泛起的病变,为预防事情提供一个可靠的指导”。好比华为、腾讯等公司已最先使用生物大数据来视察人们的康健状态,例如判断病人是否患了肿瘤,通过基因组视察肿瘤患者的潜在特征,为疾病预防、诊断、预后等精准治疗提供分子依据等。
我国的生物大数据中心与国际相比起步较晚:2015年酝酿,2016年永利集团建设“生命与康健大数据中心”,2019年,国家批准建设“国家基因组科学数据中心”和“国家生物信息中心”,这批注我国对生物大数据等领域的建设越来越重视。
建设生物大数据中心
说到生物大数据中心的建设,章张用了“一穷二白”和“探索前行”两个词来形容。筹建前期,研究所里相关领域的几个课题组在差别的偏向起劲开拓,虽然建设了一些数据库,但还不敷完善,却为以后的生长积攒了主要的履历和手艺。2016年,才有了“生命与康健大数据中心”的降生。
既然要做,就要做到最好。在生命与康健大数据中心建设初期,章张及其团队就将目的锁定为国际三大数据中心,最先了艰难“创业”。首先是梳理数据、查漏补缺,章张把每个课题组的前期基础举行了优化整合,从数据的差别条理、类型和角度把数据资源系统建设起来。之后,又接纳“请进来、走出去”的要领,起劲向国际三大数据中心学习,建设国际科学咨询委员会,约请国际着名专家给予名贵建媾和意见,团队成员多次赴美国NCBI、欧洲EBI等多个机构学习交流履历,正如章张所说:“我们把口号喊出来了,就得拼尽全力。”
科研之路历来都不会是一帆风顺的。在生命科学领域揭晓文章时,按老例需要把所有的数据提交到国际三大生物数据中心,但这些数据关于我国的科研事情者来说,是极其名贵的资源。尤其是生物数据具有“海量”的特点:通俗的电脑硬盘是1TB,1TB即是1024GB,一篇论文的数据可能就会有几十TB甚至上百TB之多。抛开重大多变的国际形势不谈,一旦遭遇自然灾难等意外,就会严重影响到我国相关领域的科研历程。
好比在2006年,一园地动造成了太平洋海底光缆故障,导致了我国学者在一段时期内无法会见外洋数据库的情形泛起。“科学无国界,但科学家有祖国”。我国的学者一直希望把这些珍贵的研究效果和数据保存一份在海内,用于祖国建设和民生福祉。为此,在中心筹建伊始,章张团队就未雨绸缪,与各大期刊及学者相同相助,把科学数据治理的本土化事情做到了前面,为我国数据清静治理和共享使用提供了有力包管。
是学者,亦是师者
2020年秋天,章张成为国科大“领雁金奖”的获得者,这既是对他身为一名“学者”,怀抱信心、学识扎实的一定,也是对他作为一位“师者”,以身作则、仁爱仁心的认同。
谈到人才作育,章张娓娓道来:“我以为学生作育最主要的一条就是因材施教、因人而异,由于每个学生的学科配景和兴趣偏向都纷歧样。每当招收新生时,我都会告诉他们,这几年你们在学业方面最主要的一小我私家就是我,以是一定要把小我私家诉求和想法告诉我,充分相同后,我可以把实现的途径以及远景勾画出来,阻止你们走太多弯路和错路。”
章张很愿意花更多时间去陪学生,和他们相同科研问题、相识他们的学习生涯。在章张眼中,判断一小我私家热爱的标准,是看他是否愿意为之支付时间。而用大宗精神指导学生,就是章张爱学生最好的证实。
关于团队建设,章张以为一支步队,最主要的就是团结和相助。章先生经常勉励学生在完成自己课题的同时,多多加入组内其他课题的研究。“把自己项目做深,是深度;和其他项目相助,是广度。同时拥有两个维度的磨炼,关于学生来讲是大有利益的。”章张希望,从自己团队走出来的学生,在履历了双维度训练后,都能成为小我私家水平突出、协作能力优异的万能型人才。
之以是说章张是才兼文武的“仙人”导师,是由于除了学术,章先生照旧一位体育健将。事情之余,章张经常通过带学生踢球、爬山、散步等方法,来缓解各人科研方面的压力。刘琳是章张的博士研究生,然而,善于学术研究的她对户外运动方面兴趣全无。“先生经�;岽颐侨グ铝制タ斯吧⒉�,我是一个很宅的人,先生有时间看我太懒了,就会来我们办公室,‘抓’我们出去磨炼。”厥后,章张在和另一位学生散步时,无意讨论出了一个新的课题偏向,“这个新闻让我们都特殊振奋,这下都愿意和先生出去散步磨炼了,哈哈。”
“人生最巧妙的事情莫过于缘分”,刘琳回忆道,在一次西山秋游中,章张走到一处山坡,突然以为似曾相识,赶忙掏脱手机翻看,“章先生在手机里找到一张照片,是他2012年回国不久,带学生在这里春游拍下的,于是我们就在原处,凭证原来的行动又留念了一张。”七年时光,岁月流转,章张已褪去了初回国时青涩的外表,学生也作育了一批又一批,而稳固的是对育人和科研的热爱与执着。
“北京有家烧烤叫柳叶刀,若是能在《柳叶刀》期刊揭晓一篇文章,就可以在那里免费吃一顿”,章张说道,“有时间学生发了文章,我就会带着他们去那里聚一聚,边吃边‘立志’。”这家饭店会凭证揭晓论文的影响因子给予响应的折扣,虽然现在已经不提倡关注文章的影响因子,但师生间的兴趣在于科研压力之余的一期一会,和久违小聚时的一谈一笑。
人能尽其才则百事兴,现在,国家基因组科学数据中心在章张及其团队的起劲下已初具规模,但由于我国在这方面起步较晚,要做的事情尚有许多。关于未来,章张期望国家可以对生物信息学的作用给予一连的关注与支持,希望包括数学、盘算机、物理、化学、医学等差别学科配景的人才,可以投身到生物信息学研究领域来。(原问题:章张:才兼文武的“仙人”导师 作者系国科大记者团成员)