阿尔兹海默症(Alzheimer’s disease,AD)是一种在晚年人人群中常见的神经退行性疾病,现在无有用治疗手段。人们对AD致病机理方面的研究也没有取得突破性的希望。为了能够更好的助力AD相关的研究,基因组研究所雷红星研究组通过整合差别泉源的数据,以阿尔兹海默症扰动基由于焦点整理并开发了阿尔兹海默症基因知识库AlzBase,相关论文于近期揭晓于Molecular Neurobiology。
雷红星研究员多年来一直从事AD相关的研究事情,特殊是在组学数据相关的研究领域该项目组开展了一系列的研究,例如AD相关致病机制的系统生物学研究,AD外周血扰动特异性研究已经AD相关染色体区域的研究等。这些研究效果为Alzbase的开发与上线打下了坚实的基础,同时也使得AlzBase作为AD组学研究领域的知识型数据库更具专业性和指导性。
AlzBase知识库网络了若干组代表性的AD脑转录组研究效果,并团结AD研究中的一些热门问题整合了近几年揭晓的AD外周血转录组数据和几种被以为与AD相近的神经推行性疾病的研究效果,使得知识库既可提供AD相关基因扰动知识又可在扰动特异性等方面提供有价值的参考信息。用户可凭证检索需求举行单个基因的盘问,也可举行批量搜索;AlzBase知识库的焦点信息是基因在各个数据集中的扰动频率信息,高扰动频率意味着有多组自力实验的支持,因此更具参考意义。除扰动频率信息外,知识库还提供了基因与疾病历程相关性信息以及基因功效和基因调控方面的注释信息,这些信息的加入使得AlzBase对AD基因知识的注释越发周全,相关的检索事情越发利便快捷。另外,AlzBase知识库依据上述数据举行基因主要性排名获得了109个AD脑转录组扰动焦点基因,并发明这些焦点基因在共表达网络中体现出较高的毗连强度。
该数据库的开发和上线一方面总结和富厚了人们关于阿尔兹海默症相关组学研究的研究效果,另一方面有助于科研职员迅速有用的对相关基因在阿尔兹海默症中的主要性举行评估和筛选,具有一定的理论意义和较强的适用意义。

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