诱导多醒目细胞(iPS细胞)的建设是近年来生命科学领域的一大突破,由日本科学家山中伸弥使用胚胎干细胞中高表达的4个转录因子转化后建设。转化的成体细胞,经重编程可回复为未分解的多能状态。因iPS细胞具有类似胚胎干细胞的分解潜能,具有发育成种种成体组织以及个体的能力,因此在再生医疗领域有着灼烁的应用远景。可是由于iPS细胞整合有外源的转录因子,iPS细胞的清静性一直是业界争论的焦点,从而限制了iPS细胞在临床领域的应用,为此对iPS细胞的清静性和遗传危害举行科学评估十分须要。
克日,永利集团精准基因组医学重点实验室蔡军研究组,与同济大学生命科学与手艺学院高绍荣教授研究组和中国农业大学动物科技学院田见晖教授研究组睁开相助研究,基于前期建设的iPS细胞一连诱导重编程系统,通过二代测序和生物信息剖析,从基因组水平展现了iPS小鼠活力逐代降低的缘故原由,确立了基因突变对iPS细胞发育潜能的影响,为iPS细胞的清静应用提供了遗传学指导。相关研究效果揭晓在Nature Communications 期刊。
该研究通过四倍体囊胚赔偿的要领,建设了一连六代诱导重编程系统,每次重编程对应一代iPS细胞以及由其发育而成的iPS小鼠,系统中iPS小鼠活力随着重编程的次数逐代降低,为研究iPS细胞的清静性提供了优异模子。通过对一连的各代样品举行基因组测序剖析,发明iPS小鼠活力降低陪同着大宗单核苷酸突变(SNVs)的积累,对这些SNVs的功效剖析发明,由于碱基突变导致的异常表型与致死小鼠的组织病理信息一致,从而证实一连诱导重编程历程中爆发的SNVs会影响iPS细胞的发育潜能,继而影响到由iPS细胞发育而来的个体以及组织的活力和生物学功效。
进一步的微滴数字PCR实验批注,积累的SNVs部分爆发于个体发育历程中,而经由诱导重编程后,单细胞特异的遗传突变在克隆膨胀后在续细胞中稳固保存下来。该研究科学评估了影响iPS细胞清静性的遗传危害泉源,为后续iPS细胞应用时,成体细胞的泉源提供参考。别的,研究中发明的多醒目细胞特有的逆转座子缺失征象也值得后续深入研究和关注。
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一连诱导重编程历程中积累的单核苷酸突变的动态转变