结核病已一连两年凌驾HIV成为全球第一大熏染病。据WHO结核年报报道,2015年全球新增结核病例1,040万,殒命180万。另外,现在全球约有三分之一生齿(约20亿)为结核菌携带者,熏染者中约1/10的人最终会生长为运动性结核。结核分枝杆菌复合群(MTBC)是引发结核病的元凶,其成员在基因组序列上极为守旧,一致性凌驾99%,可是差别谱系的菌株在毒力、宿主顺应性等方面保存较大表型差别,这可能是MTBC菌株与差别的宿主之间恒久共进化的效果。恒久的地理隔离导致了基因型隔离与遗传隔离,从而进一步造成MTBC表型的差别。为了展现差别MTBC菌株致病性、宿主顺应性等表型差别的遗传基础,探寻高度守旧的MTBC基因型和多样化表型之间的联系,北京基因组所基因组科学与信息重点实验室陈非研究组与首都医科大学隶属北京胸科医院暨国家结核病临床实验室黄海荣研究组相助,选取了分属差别谱系(包括标准株H37Ra、H37Rv、牛结核、卡介苗)、顺应于差别宿主且体现出差别致病性的12株MTBC菌株,借助较量基因组学手段,周全展现了导致MTBC宿主顺应性、毒力和免疫原性差别的遗传基础。
科研职员通过对熏染差别宿主的结核杆菌的较量剖析,发明了三类只保存于人源菌株中的基因,包括2个烯酰辅酶A水合酶、5个PE/PPE家族卵白和8个mce3家族卵白。这些基因中的绝大大都已被实验证实在结核毒力和免疫中施展主要的作用,它们在动物源菌株中的特异性缺失极有可能导致结核杆菌宿主顺应性差别。通过对MTBC毒力因子的剖析发明13个只保存北京系中的SNPs,它们很可能是导致北京系菌株毒力更强的缘故原由之一;对实验室最常用的标准有毒株H37Rv与无毒株H37Ra的较量,发明3个可能导致H37Ra毒力削弱的突变位点,包括已被实验验证的S219L (PhoP)、A219E (MazG) 和1个新发明的I228M (EspK);对动物源有毒株牛结核杆菌和弱毒株(卡介苗及田鼠分枝杆菌)的剖析发明,RD1区域的前4个基因而非古板看法以是为的整个RD1区可能是导致动物源结核杆菌毒力削弱的缘故原由。通过对MTBC抗原决议簇的剖析发明,北京系菌株特异缺失了4个抗原决议簇,它们的缺失可能导致北京系菌株的免疫逃逸,从而毒性更强。别的,差别宿主的结核杆菌在抗原决议簇上也保存差别,反应了差别宿主的结核杆菌与响应宿主之间特异的免疫反应。
该研究展现了导致MTBC菌株表型差别的基因组突变,增强了关于MTBC基因组云云守旧而表型差别云云显著的明确。别的,在整个MTBC规模内系统的较量基因组学研究为更好的明确MTBC的致病机制涤讪了基础,为结核病的防治提供了新的检测靶标,进一步增进了针对结核病疫苗的研发。
该效果于2017年3月在线揭晓于Front. Cell. Infect. Microbiol.期刊。该项研究获得永利集团重点安排项目、重大熏染病防治重大专项等资助。
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高度守旧的基因型和差别显著的表型